Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN30

BNC2, Zinc finger protein basonuclin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2Q6ZN30 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNC2Q6ZN30 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BNC2Q6ZN30 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BNC2Q6ZN30 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BNC2Q6ZN30 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNC2Q6ZN30 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BNC2Q6ZN30 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BNC2Q6ZN30 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BNC2Q6ZN30 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BNC2Q6ZN30 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BNC2Q6ZN30 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BNC2Q6ZN30 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNC2Q6ZN30 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNC2Q6ZN30 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNC2Q6ZN30 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNC2Q6ZN30 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNC2Q6ZN30 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNC2Q6ZN30 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNC2Q6ZN30 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNC2Q6ZN30 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNC2Q6ZN30 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNC2Q6ZN30 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNC2Q6ZN30 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNC2Q6ZN30 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BNC2Q6ZN30 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNC2Q6ZN30 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNC2Q6ZN30 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNC2Q6ZN30 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms