Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OPN5Q6U736 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OPN5Q6U736 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
OPN5Q6U736 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OPN5Q6U736 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OPN5Q6U736 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OPN5Q6U736 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
OPN5Q6U736 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OPN5Q6U736 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
OPN5Q6U736 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OPN5Q6U736 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OPN5Q6U736 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OPN5Q6U736 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OPN5Q6U736 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
OPN5Q6U736 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OPN5Q6U736 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
OPN5Q6U736 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
OPN5Q6U736 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
OPN5Q6U736 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
OPN5Q6U736 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
OPN5Q6U736 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
OPN5Q6U736 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
OPN5Q6U736 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
OPN5Q6U736 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
OPN5Q6U736 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
OPN5Q6U736 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
OPN5Q6U736 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
OPN5Q6U736 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
OPN5Q6U736 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
OPN5Q6U736 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
OPN5Q6U736 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OPN5Q6U736 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OPN5Q6U736 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OPN5Q6U736 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OPN5Q6U736 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OPN5Q6U736 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OPN5Q6U736 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OPN5Q6U736 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OPN5Q6U736 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OPN5Q6U736 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OPN5Q6U736 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms