Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B1

RNF219, RING finger protein 219, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF219Q5W0B1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF219Q5W0B1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF219Q5W0B1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF219Q5W0B1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF219Q5W0B1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF219Q5W0B1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF219Q5W0B1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF219Q5W0B1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF219Q5W0B1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF219Q5W0B1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF219Q5W0B1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF219Q5W0B1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF219Q5W0B1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF219Q5W0B1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF219Q5W0B1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF219Q5W0B1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF219Q5W0B1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF219Q5W0B1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF219Q5W0B1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF219Q5W0B1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF219Q5W0B1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF219Q5W0B1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF219Q5W0B1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms