Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC4Q5GLZ8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HERC4Q5GLZ8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.8 ms