Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SV2CQ496J9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SV2CQ496J9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SV2CQ496J9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SV2CQ496J9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SV2CQ496J9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SV2CQ496J9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SV2CQ496J9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2CQ496J9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2CQ496J9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2CQ496J9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2CQ496J9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2CQ496J9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2CQ496J9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2CQ496J9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2CQ496J9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2CQ496J9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SV2CQ496J9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2CQ496J9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SV2CQ496J9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms