Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF212Q495C1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNF212Q495C1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms