Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VWC2Q2TAL6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VWC2Q2TAL6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms