Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL23Q16540 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL23Q16540 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL23Q16540 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL23Q16540 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL23Q16540 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL23Q16540 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL23Q16540 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL23Q16540 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL23Q16540 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL23Q16540 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL23Q16540 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL23Q16540 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL23Q16540 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL23Q16540 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL23Q16540 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL23Q16540 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL23Q16540 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL23Q16540 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL23Q16540 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL23Q16540 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL23Q16540 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL23Q16540 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MRPL23Q16540 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MRPL23Q16540 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MRPL23Q16540 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MRPL23Q16540 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL23Q16540 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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