Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA1EQ15878 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1EQ15878 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms