Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
NKX1-1Q15270 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NKX1-1Q15270 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NKX1-1Q15270 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms