Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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FAT1Q14517 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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FAT1Q14517 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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FAT1Q14517 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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FAT1Q14517 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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FAT1Q14517 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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FAT1Q14517 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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FAT1Q14517 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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FAT1Q14517 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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FAT1Q14517 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAT1Q14517 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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FAT1Q14517 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAT1Q14517 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAT1Q14517 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAT1Q14517 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAT1Q14517 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAT1Q14517 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAT1Q14517 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAT1Q14517 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAT1Q14517 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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