Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CUL3Q13618 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
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