Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX1Q13596 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX1Q13596 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX1Q13596 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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