Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 PKM-219ENST00000567118 2254 ntTSL 213.89□□□□□ -0.196e-11■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.492e-6■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.65e-7■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.455e-7■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 GSPT1-201ENST00000420576 1603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.485e-7■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 GSPT1-208ENST00000565267 1864 ntTSL 510.37□□□□□ -0.755e-7■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 GSPT1-206ENST00000563468 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.855e-7■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 ATP5A1-209ENST00000589611 995 ntTSL 211.88□□□□□ -0.511e-9■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.941e-6■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 PRMT5-208ENST00000553417 259 ntTSL 38.5□□□□□ -1.052e-7■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 DDX17-206ENST00000467279 712 ntTSL 529.29■■■□□ 2.283e-8■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.931e-6■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.521e-6■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.471e-6■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 TUFM-204ENST00000569217 814 ntTSL 222.05■■□□□ 1.122e-9■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 MTHFD1-212ENST00000555858 386 ntTSL 53.49□□□□□ -1.851e-6■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 SOD1-204ENST00000476106 586 ntTSL 517.01■□□□□ 0.316e-7■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 CCT7-207ENST00000469844 612 ntTSL 417.98■□□□□ 0.472e-11■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 NDUFS1-208ENST00000456284 563 ntTSL 48.27□□□□□ -1.091e-6■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 RNH1-217ENST00000529768 1019 ntTSL 227.63■■■□□ 2.014e-7■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 RNH1-210ENST00000525701 1794 ntTSL 525.66■■□□□ 1.74e-7■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.694e-7■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.64e-7■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.594e-7■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.484e-7■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 RNH1-207ENST00000524464 624 ntTSL 522.59■■□□□ 1.214e-7■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.174e-7■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.044e-7■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.994e-7■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.24e-7■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 RNH1-209ENST00000525522 3281 ntTSL 1 (best)15.37■□□□□ 0.054e-7■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.222e-6■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.594e-7■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 FBL-204ENST00000594443 805 ntTSL 315.51■□□□□ 0.074e-7■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 PSMC2-206ENST00000640277 1357 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.672e-6■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 PSMC2-201ENST00000292644 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.752e-6■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 PSMC2-203ENST00000435765 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.872e-6■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 MRPS27-204ENST00000508863 956 ntTSL 316.28■□□□□ 0.23e-6■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 PARP1-207ENST00000490921 3165 ntTSL 210.55□□□□□ -0.726e-7■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.736e-7■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 PRMT5-224ENST00000557015 628 ntTSL 224.34■■□□□ 1.495e-6■■■□□ 18.3
G3BP1Q13283 FLNA-209ENST00000444578 843 ntTSL 320.71■□□□□ 0.911e-10■■■□□ 18.2
G3BP1Q13283 SPTAN1-228ENST00000635853 5870 ntTSL 511.78□□□□□ -0.522e-7■■■□□ 18.2
G3BP1Q13283 QARS-221ENST00000494767 1023 ntTSL 516.55■□□□□ 0.243e-7■■■□□ 18.2
G3BP1Q13283 QARS-245ENST00000635541 907 ntTSL 315.48■□□□□ 0.073e-7■■■□□ 18.2
G3BP1Q13283 FLNB-209ENST00000477629 2058 ntTSL 215.84■□□□□ 0.131e-26■■■□□ 18.2
G3BP1Q13283 CKAP5-207ENST00000526943 563 ntTSL 44.41□□□□□ -1.72e-6■■■□□ 18.2
G3BP1Q13283 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.111e-6■■■□□ 18.2
G3BP1Q13283 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.051e-6■■■□□ 18.2
G3BP1Q13283 ADD1-219ENST00000514940 1332 ntTSL 514.53□□□□□ -0.085e-7■■■□□ 18.2
G3BP1Q13283 LRRC59-202ENST00000503118 438 ntTSL 59.1□□□□□ -0.952e-7■■■□□ 18.2
G3BP1Q13283 ATP5A1-210ENST00000589869 910 ntTSL 318.16■□□□□ 0.58e-10■■■□□ 18.2
G3BP1Q13283 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.314e-9■■■□□ 18.2
G3BP1Q13283 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.174e-9■■■□□ 18.2
G3BP1Q13283 FLNA-206ENST00000420627 8225 ntTSL 515.8■□□□□ 0.124e-9■■■□□ 18.2
G3BP1Q13283 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.044e-9■■■□□ 18.2
G3BP1Q13283 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.014e-9■■■□□ 18.2
G3BP1Q13283 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.114e-9■■■□□ 18.2
G3BP1Q13283 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.134e-9■■■□□ 18.2
G3BP1Q13283 FADS2-213ENST00000523235 5073 ntTSL 217.21■□□□□ 0.353e-13■■■□□ 18.2
G3BP1Q13283 EIF4A3-202ENST00000570625 562 ntTSL 24.78□□□□□ -1.642e-6■■■□□ 18.2
G3BP1Q13283 GDI2-205ENST00000447751 834 ntTSL 33.76□□□□□ -1.816e-8■■■□□ 18.2
G3BP1Q13283 SMARCA4-212ENST00000586985 534 ntTSL 518.02■□□□□ 0.482e-9■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 SMARCA4-219ENST00000592604 2940 ntTSL 1 (best)17.61■□□□□ 0.412e-9■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 SMARCA4-208ENST00000585799 3842 ntTSL 215.27■□□□□ 0.042e-9■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 SMARCA4-217ENST00000591595 3377 ntTSL 214.06□□□□□ -0.162e-9■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 BCOR-202ENST00000378444 6358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.151e-6■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 BCOR-201ENST00000342274 6390 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.41e-6■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 BCOR-205ENST00000397354 6258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.41e-6■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.641e-6■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 FDFT1-206ENST00000525571 810 ntTSL 322.84■■□□□ 1.259e-18■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 FDFT1-211ENST00000527045 642 ntTSL 1 (best)10.4□□□□□ -0.749e-18■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.514e-6■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.574e-6■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.642e-12■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.92e-12■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.12e-12■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 HSPA8-209ENST00000526862 504 ntTSL 35.61□□□□□ -1.514e-8■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 GPI-203ENST00000586077 3053 nt11.91□□□□□ -0.52e-7■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 ABCF1-203ENST00000441867 1074 ntTSL 511.21□□□□□ -0.611e-7■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 PRDX6-203ENST00000470017 859 ntTSL 29.48□□□□□ -0.893e-10■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 PRDX6-201ENST00000340385 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.113e-10■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 CTNNA1-202ENST00000517533 579 ntTSL 36.74□□□□□ -1.338e-8■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 CTNNA1-239ENST00000523685 694 ntTSL 36.4□□□□□ -1.388e-8■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 CTNNA1-232ENST00000522013 874 ntTSL 35.82□□□□□ -1.488e-8■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 CTNNA1-233ENST00000522052 579 ntTSL 45.82□□□□□ -1.488e-8■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 CTNNA1-222ENST00000520400 589 ntTSL 45.03□□□□□ -1.68e-8■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 CTNNA1-238ENST00000523298 577 ntTSL 25.03□□□□□ -1.68e-8■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 UROD-210ENST00000466193 524 ntTSL 223.04■■□□□ 1.284e-6■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 UROD-209ENST00000465678 756 ntTSL 215.75■□□□□ 0.114e-6■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 UROD-212ENST00000472254 934 ntTSL 214.3□□□□□ -0.124e-6■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 RARS-202ENST00000518757 580 ntTSL 54.89□□□□□ -1.638e-8■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 VARS-227ENST00000489979 658 ntTSL 317.16■□□□□ 0.342e-7■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.331e-6■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 PGD-205ENST00000483936 680 ntTSL 514.33□□□□□ -0.121e-6■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 CTNNA1-226ENST00000521368 544 ntTSL 417.09■□□□□ 0.339e-9■■■□□ 18.1
G3BP1Q13283 HSD17B4-227ENST00000522415 900 ntTSL 58.04□□□□□ -1.125e-7■■■□□ 18
G3BP1Q13283 HSD17B4-214ENST00000509951 736 ntTSL 54.42□□□□□ -1.75e-7■■■□□ 18
G3BP1Q13283 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.849e-7■■■□□ 18
G3BP1Q13283 ARID1A-204ENST00000430799 6521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.279e-7■■■□□ 18
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