Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EFEMP1Q12805 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFEMP1Q12805 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
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