Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSBP1Q04837 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSBP1Q04837 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms