Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF85Q03923 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF85Q03923 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF85Q03923 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF85Q03923 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF85Q03923 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF85Q03923 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF85Q03923 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF85Q03923 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF85Q03923 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF85Q03923 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF85Q03923 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF85Q03923 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF85Q03923 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF85Q03923 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF85Q03923 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF85Q03923 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF85Q03923 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF85Q03923 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF85Q03923 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF85Q03923 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF85Q03923 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF85Q03923 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF85Q03923 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF85Q03923 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF85Q03923 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF85Q03923 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF85Q03923 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF85Q03923 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF85Q03923 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms