Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL8P80075 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL8P80075 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL8P80075 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL8P80075 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL8P80075 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL8P80075 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL8P80075 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL8P80075 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL8P80075 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL8P80075 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL8P80075 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL8P80075 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL8P80075 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCL8P80075 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL8P80075 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL8P80075 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL8P80075 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL8P80075 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL8P80075 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL8P80075 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL8P80075 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL8P80075 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL8P80075 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCL8P80075 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCL8P80075 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCL8P80075 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCL8P80075 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCL8P80075 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCL8P80075 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCL8P80075 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL8P80075 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL8P80075 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL8P80075 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL8P80075 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL8P80075 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL8P80075 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL8P80075 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL8P80075 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL8P80075 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL8P80075 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL8P80075 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCL8P80075 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCL8P80075 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCL8P80075 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCL8P80075 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCL8P80075 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCL8P80075 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCL8P80075 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCL8P80075 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCL8P80075 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCL8P80075 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCL8P80075 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCL8P80075 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCL8P80075 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCL8P80075 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCL8P80075 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCL8P80075 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCL8P80075 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCL8P80075 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCL8P80075 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCL8P80075 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCL8P80075 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCL8P80075 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCL8P80075 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCL8P80075 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCL8P80075 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCL8P80075 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCL8P80075 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCL8P80075 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCL8P80075 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCL8P80075 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCL8P80075 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCL8P80075 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCL8P80075 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCL8P80075 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCL8P80075 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCL8P80075 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCL8P80075 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCL8P80075 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCL8P80075 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCL8P80075 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCL8P80075 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCL8P80075 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCL8P80075 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCL8P80075 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCL8P80075 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCL8P80075 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCL8P80075 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCL8P80075 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCL8P80075 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCL8P80075 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCL8P80075 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCL8P80075 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCL8P80075 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCL8P80075 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCL8P80075 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCL8P80075 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCL8P80075 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCL8P80075 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms