Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
YARSP54577 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YARSP54577 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YARSP54577 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YARSP54577 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YARSP54577 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
YARSP54577 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
YARSP54577 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
YARSP54577 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
YARSP54577 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YARSP54577 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
YARSP54577 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YARSP54577 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YARSP54577 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YARSP54577 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
YARSP54577 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YARSP54577 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YARSP54577 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YARSP54577 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YARSP54577 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YARSP54577 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YARSP54577 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YARSP54577 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
YARSP54577 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
YARSP54577 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
YARSP54577 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YARSP54577 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
YARSP54577 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YARSP54577 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
YARSP54577 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YARSP54577 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YARSP54577 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
YARSP54577 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YARSP54577 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YARSP54577 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
YARSP54577 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
YARSP54577 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
YARSP54577 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YARSP54577 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
YARSP54577 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YARSP54577 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
YARSP54577 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YARSP54577 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YARSP54577 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YARSP54577 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
YARSP54577 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
YARSP54577 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
YARSP54577 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YARSP54577 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YARSP54577 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YARSP54577 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
YARSP54577 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
YARSP54577 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
YARSP54577 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YARSP54577 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YARSP54577 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YARSP54577 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YARSP54577 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
YARSP54577 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YARSP54577 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YARSP54577 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YARSP54577 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YARSP54577 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YARSP54577 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YARSP54577 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YARSP54577 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YARSP54577 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YARSP54577 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YARSP54577 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YARSP54577 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YARSP54577 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YARSP54577 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YARSP54577 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YARSP54577 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YARSP54577 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YARSP54577 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YARSP54577 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YARSP54577 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YARSP54577 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YARSP54577 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YARSP54577 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YARSP54577 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YARSP54577 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YARSP54577 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YARSP54577 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YARSP54577 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
YARSP54577 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YARSP54577 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YARSP54577 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YARSP54577 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YARSP54577 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YARSP54577 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YARSP54577 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YARSP54577 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YARSP54577 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YARSP54577 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YARSP54577 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YARSP54577 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YARSP54577 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YARSP54577 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms