Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFNA3P52797 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.33■■□□□ 1
EFNA3P52797 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EFNA3P52797 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EFNA3P52797 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EFNA3P52797 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EFNA3P52797 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EFNA3P52797 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
EFNA3P52797 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
EFNA3P52797 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFNA3P52797 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EFNA3P52797 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EFNA3P52797 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFNA3P52797 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EFNA3P52797 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EFNA3P52797 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFNA3P52797 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EFNA3P52797 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms