Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP12P39900 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP12P39900 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP12P39900 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP12P39900 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP12P39900 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP12P39900 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP12P39900 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP12P39900 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP12P39900 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP12P39900 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP12P39900 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP12P39900 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP12P39900 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP12P39900 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP12P39900 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP12P39900 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP12P39900 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP12P39900 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP12P39900 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP12P39900 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP12P39900 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP12P39900 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP12P39900 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP12P39900 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP12P39900 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP12P39900 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP12P39900 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP12P39900 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP12P39900 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP12P39900 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP12P39900 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP12P39900 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP12P39900 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP12P39900 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP12P39900 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP12P39900 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP12P39900 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP12P39900 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP12P39900 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP12P39900 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP12P39900 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP12P39900 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP12P39900 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP12P39900 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP12P39900 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP12P39900 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP12P39900 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP12P39900 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP12P39900 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP12P39900 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP12P39900 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP12P39900 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP12P39900 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP12P39900 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP12P39900 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP12P39900 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP12P39900 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP12P39900 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP12P39900 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP12P39900 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP12P39900 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP12P39900 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP12P39900 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP12P39900 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP12P39900 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP12P39900 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP12P39900 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP12P39900 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP12P39900 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP12P39900 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP12P39900 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP12P39900 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP12P39900 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP12P39900 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP12P39900 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP12P39900 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP12P39900 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP12P39900 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP12P39900 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP12P39900 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP12P39900 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP12P39900 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP12P39900 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP12P39900 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP12P39900 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP12P39900 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP12P39900 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP12P39900 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP12P39900 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP12P39900 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP12P39900 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP12P39900 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP12P39900 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP12P39900 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP12P39900 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP12P39900 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP12P39900 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP12P39900 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP12P39900 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms