Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SFNP31947 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFNP31947 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFNP31947 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFNP31947 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFNP31947 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFNP31947 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFNP31947 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFNP31947 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFNP31947 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFNP31947 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFNP31947 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFNP31947 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFNP31947 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SFNP31947 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SFNP31947 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SFNP31947 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SFNP31947 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SFNP31947 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SFNP31947 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SFNP31947 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SFNP31947 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFNP31947 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFNP31947 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFNP31947 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFNP31947 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFNP31947 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFNP31947 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFNP31947 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFNP31947 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFNP31947 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFNP31947 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFNP31947 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFNP31947 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFNP31947 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFNP31947 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFNP31947 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFNP31947 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFNP31947 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFNP31947 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFNP31947 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFNP31947 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFNP31947 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFNP31947 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFNP31947 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFNP31947 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFNP31947 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFNP31947 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFNP31947 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFNP31947 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFNP31947 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFNP31947 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFNP31947 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFNP31947 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SFNP31947 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFNP31947 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SFNP31947 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFNP31947 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFNP31947 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFNP31947 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFNP31947 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFNP31947 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SFNP31947 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFNP31947 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFNP31947 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFNP31947 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFNP31947 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFNP31947 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFNP31947 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFNP31947 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFNP31947 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFNP31947 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SFNP31947 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SFNP31947 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SFNP31947 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SFNP31947 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SFNP31947 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFNP31947 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFNP31947 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFNP31947 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFNP31947 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFNP31947 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFNP31947 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFNP31947 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFNP31947 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFNP31947 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFNP31947 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFNP31947 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFNP31947 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFNP31947 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFNP31947 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFNP31947 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFNP31947 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFNP31947 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFNP31947 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFNP31947 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFNP31947 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SFNP31947 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SFNP31947 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SFNP31947 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms