Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCHP24723 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCHP24723 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
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