Protein–RNA interactions for Protein: P12931

SRC, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCP12931 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRCP12931 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRCP12931 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRCP12931 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRCP12931 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRCP12931 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SRCP12931 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRCP12931 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRCP12931 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRCP12931 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SRCP12931 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRCP12931 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRCP12931 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRCP12931 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRCP12931 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRCP12931 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRCP12931 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRCP12931 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SRCP12931 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRCP12931 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRCP12931 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRCP12931 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRCP12931 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRCP12931 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRCP12931 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRCP12931 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRCP12931 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRCP12931 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRCP12931 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRCP12931 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRCP12931 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRCP12931 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRCP12931 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRCP12931 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRCP12931 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRCP12931 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRCP12931 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRCP12931 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRCP12931 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRCP12931 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRCP12931 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRCP12931 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRCP12931 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRCP12931 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRCP12931 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRCP12931 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRCP12931 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRCP12931 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRCP12931 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRCP12931 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRCP12931 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRCP12931 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRCP12931 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SRCP12931 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRCP12931 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRCP12931 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SRCP12931 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRCP12931 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRCP12931 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRCP12931 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SRCP12931 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRCP12931 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRCP12931 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRCP12931 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRCP12931 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRCP12931 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRCP12931 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SRCP12931 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRCP12931 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRCP12931 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRCP12931 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRCP12931 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRCP12931 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRCP12931 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRCP12931 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRCP12931 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRCP12931 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRCP12931 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRCP12931 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRCP12931 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRCP12931 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRCP12931 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRCP12931 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRCP12931 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRCP12931 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRCP12931 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRCP12931 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SRCP12931 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRCP12931 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRCP12931 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRCP12931 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRCP12931 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRCP12931 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRCP12931 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRCP12931 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRCP12931 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRCP12931 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRCP12931 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRCP12931 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRCP12931 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms