Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP1P11387 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP1P11387 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP1P11387 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP1P11387 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP1P11387 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP1P11387 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP1P11387 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP1P11387 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP1P11387 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP1P11387 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP1P11387 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP1P11387 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP1P11387 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP1P11387 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP1P11387 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP1P11387 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP1P11387 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP1P11387 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP1P11387 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP1P11387 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP1P11387 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP1P11387 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP1P11387 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP1P11387 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP1P11387 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP1P11387 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP1P11387 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP1P11387 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP1P11387 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP1P11387 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP1P11387 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP1P11387 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP1P11387 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP1P11387 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP1P11387 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP1P11387 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP1P11387 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP1P11387 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP1P11387 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP1P11387 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP1P11387 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP1P11387 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP1P11387 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP1P11387 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP1P11387 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP1P11387 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP1P11387 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP1P11387 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP1P11387 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP1P11387 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP1P11387 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP1P11387 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TOP1P11387 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TOP1P11387 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TOP1P11387 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TOP1P11387 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP1P11387 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP1P11387 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP1P11387 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP1P11387 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP1P11387 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP1P11387 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP1P11387 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP1P11387 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP1P11387 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP1P11387 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP1P11387 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP1P11387 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP1P11387 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOP1P11387 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOP1P11387 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOP1P11387 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOP1P11387 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOP1P11387 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOP1P11387 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOP1P11387 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOP1P11387 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOP1P11387 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOP1P11387 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOP1P11387 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOP1P11387 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOP1P11387 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOP1P11387 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOP1P11387 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOP1P11387 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOP1P11387 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOP1P11387 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOP1P11387 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOP1P11387 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOP1P11387 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOP1P11387 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOP1P11387 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOP1P11387 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOP1P11387 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOP1P11387 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TOP1P11387 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOP1P11387 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOP1P11387 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TOP1P11387 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms