Protein–RNA interactions for Protein: P01772

IGHV3-33, Immunoglobulin heavy variable 3-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-33P01772 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGHV3-33P01772 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGHV3-33P01772 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms