Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP3K13O43283 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP3K13O43283 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms