Protein–RNA interactions for Protein: O14521

SDHD, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHDO14521 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHDO14521 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHDO14521 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHDO14521 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHDO14521 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHDO14521 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHDO14521 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHDO14521 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHDO14521 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHDO14521 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHDO14521 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHDO14521 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHDO14521 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHDO14521 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHDO14521 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHDO14521 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHDO14521 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHDO14521 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHDO14521 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHDO14521 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHDO14521 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHDO14521 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHDO14521 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHDO14521 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHDO14521 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHDO14521 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHDO14521 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHDO14521 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHDO14521 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHDO14521 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHDO14521 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHDO14521 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHDO14521 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHDO14521 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHDO14521 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHDO14521 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHDO14521 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHDO14521 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHDO14521 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHDO14521 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHDO14521 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHDO14521 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHDO14521 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHDO14521 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHDO14521 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHDO14521 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHDO14521 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHDO14521 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHDO14521 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHDO14521 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHDO14521 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SDHDO14521 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHDO14521 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHDO14521 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHDO14521 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHDO14521 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHDO14521 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHDO14521 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHDO14521 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHDO14521 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHDO14521 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHDO14521 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHDO14521 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHDO14521 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHDO14521 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SDHDO14521 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHDO14521 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHDO14521 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SDHDO14521 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHDO14521 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHDO14521 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHDO14521 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHDO14521 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHDO14521 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHDO14521 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHDO14521 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHDO14521 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHDO14521 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHDO14521 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHDO14521 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHDO14521 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHDO14521 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHDO14521 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHDO14521 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHDO14521 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHDO14521 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHDO14521 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHDO14521 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHDO14521 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHDO14521 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHDO14521 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHDO14521 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHDO14521 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHDO14521 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHDO14521 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHDO14521 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHDO14521 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHDO14521 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHDO14521 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHDO14521 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms