Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TULP2O00295 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TULP2O00295 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TULP2O00295 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TULP2O00295 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TULP2O00295 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TULP2O00295 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TULP2O00295 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TULP2O00295 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TULP2O00295 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TULP2O00295 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TULP2O00295 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TULP2O00295 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TULP2O00295 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TULP2O00295 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TULP2O00295 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TULP2O00295 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TULP2O00295 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TULP2O00295 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TULP2O00295 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TULP2O00295 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TULP2O00295 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TULP2O00295 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TULP2O00295 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TULP2O00295 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TULP2O00295 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TULP2O00295 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TULP2O00295 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TULP2O00295 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TULP2O00295 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TULP2O00295 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TULP2O00295 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TULP2O00295 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TULP2O00295 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TULP2O00295 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TULP2O00295 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TULP2O00295 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TULP2O00295 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TULP2O00295 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TULP2O00295 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TULP2O00295 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TULP2O00295 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TULP2O00295 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TULP2O00295 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TULP2O00295 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TULP2O00295 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TULP2O00295 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TULP2O00295 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TULP2O00295 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TULP2O00295 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TULP2O00295 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TULP2O00295 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TULP2O00295 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TULP2O00295 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TULP2O00295 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TULP2O00295 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TULP2O00295 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TULP2O00295 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TULP2O00295 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TULP2O00295 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP2O00295 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP2O00295 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP2O00295 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP2O00295 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP2O00295 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP2O00295 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP2O00295 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP2O00295 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP2O00295 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TULP2O00295 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP2O00295 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP2O00295 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP2O00295 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP2O00295 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP2O00295 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP2O00295 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP2O00295 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP2O00295 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP2O00295 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP2O00295 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP2O00295 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP2O00295 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP2O00295 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP2O00295 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP2O00295 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP2O00295 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP2O00295 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP2O00295 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP2O00295 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP2O00295 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP2O00295 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP2O00295 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP2O00295 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP2O00295 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP2O00295 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP2O00295 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP2O00295 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP2O00295 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP2O00295 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP2O00295 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms