Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00587B1AMM8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00587B1AMM8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms