Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM200CA6NKL6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM200CA6NKL6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms