Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB19A4D1S5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB19A4D1S5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB19A4D1S5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB19A4D1S5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB19A4D1S5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB19A4D1S5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB19A4D1S5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB19A4D1S5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB19A4D1S5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB19A4D1S5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB19A4D1S5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB19A4D1S5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB19A4D1S5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB19A4D1S5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB19A4D1S5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB19A4D1S5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB19A4D1S5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB19A4D1S5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB19A4D1S5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms