Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YY99

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YY99 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
A0A0J9YY99 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A0A0J9YY99 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A0A0J9YY99 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A0A0J9YY99 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A0A0J9YY99 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A0A0J9YY99 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A0A0J9YY99 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A0A0J9YY99 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A0A0J9YY99 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A0A0J9YY99 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A0A0J9YY99 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A0A0J9YY99 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A0A0J9YY99 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A0A0J9YY99 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A0A0J9YY99 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A0A0J9YY99 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A0A0J9YY99 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
A0A0J9YY99 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A0A0J9YY99 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A0A0J9YY99 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
A0A0J9YY99 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms