Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YY10

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YY10 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0J9YY10 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0J9YY10 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms