Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 GPR179-204ENST00000621958 7983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SMCO1Q147U7 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMCO1Q147U7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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