Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SSPNQ14714 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms