Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MTCP1P56278 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms