Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2A2P52657 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms