Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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PSMB4P28070 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PSMB4P28070 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PSMB4P28070 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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