Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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