Protein–RNA interactions for Protein: O75128

COBL, Protein cordon-bleu, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLO75128 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLO75128 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLO75128 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLO75128 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLO75128 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLO75128 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLO75128 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLO75128 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLO75128 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLO75128 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLO75128 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLO75128 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLO75128 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLO75128 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLO75128 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLO75128 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLO75128 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLO75128 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLO75128 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLO75128 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLO75128 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLO75128 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLO75128 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLO75128 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLO75128 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLO75128 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COBLO75128 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COBLO75128 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COBLO75128 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms