Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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IKZF1Q13422 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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IKZF1Q13422 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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IKZF1Q13422 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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IKZF1Q13422 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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IKZF1Q13422 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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IKZF1Q13422 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IKZF1Q13422 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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