Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CDH17Q12864 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CDH17Q12864 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CDH17Q12864 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CDH17Q12864 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CDH17Q12864 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CDH17Q12864 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CDH17Q12864 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CDH17Q12864 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDH17Q12864 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDH17Q12864 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDH17Q12864 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDH17Q12864 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDH17Q12864 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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