Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms