Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms