Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RAB19A4D1S5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RAB19A4D1S5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RAB19A4D1S5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RAB19A4D1S5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RAB19A4D1S5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RAB19A4D1S5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RAB19A4D1S5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RAB19A4D1S5 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RAB19A4D1S5 FAM131B-202ENST00000409346 4295 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RAB19A4D1S5 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 SGK1-220ENST00000524929 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 PPARD-205ENST00000448077 3516 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RAB19A4D1S5 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms