Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPAS3Q8IXF0 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms