Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APTXQ7Z2E3 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms