Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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