Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CKAP5Q14008 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CKAP5Q14008 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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CKAP5Q14008 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CKAP5Q14008 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CKAP5Q14008 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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